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第二十章 基因-《從虐殺原形開始不死不滅》


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    這個(gè)問題遠(yuǎn)沒有這么簡單。基因組學(xué)發(fā)展到今天,圍繞它的討論和爭議,從結(jié)構(gòu)和功能基因組學(xué),到生命進(jìn)化,一直到哲學(xué),甚至到學(xué)術(shù)資源政治版圖的劃分,可以寫上一個(gè)很有趣的故事。

    存在即合理。

    這個(gè)沒錯(cuò)。

    但是,存在即有用嗎?譬如我們的闌尾和智齒,它們用處不大,麻煩不小,更多地是人類進(jìn)化過程中留下的遺跡,絕非什么寶貝。

    人類基因組中98.5%的非編碼序列,也要辯證地來看。

    早在20世紀(jì)六七十年代,人們就開始把非編碼序列稱為“垃圾dna”了。

    然而人們很快就發(fā)現(xiàn),不少非編碼序列跟基因的轉(zhuǎn)錄調(diào)控密切相關(guān)。

    垃圾并不垃圾,生命也絕非僅有中心法則。

    那么非編碼序列中都有些什么好東西呢?教科書中經(jīng)典的非編碼dna元件,如啟動(dòng)子和增強(qiáng)子,可動(dòng)遺傳因子,還有具有生物活性的小rna。

    分子生物學(xué)發(fā)展的早期,科學(xué)家為了窺破生命這一黑箱,所設(shè)計(jì)的精妙絕倫的生物化學(xué)實(shí)驗(yàn),實(shí)在令后生拍案叫絕!

    而在這高通量、大數(shù)據(jù)為王的新世紀(jì),非編碼dna研究的主力毫無疑問是encode計(jì)劃。

    這是全球大規(guī)模合作的科研項(xiàng)目的典范,生物大數(shù)據(jù)的先驅(qū)。

    全球數(shù)十個(gè)科研團(tuán)隊(duì),用最新開發(fā)的高通量實(shí)驗(yàn)方法,系統(tǒng)地,全面地掃描人類和其他生物各種組織中所有非編碼dna的生物活性。

    他們用的方法有chip-seq(檢測染色質(zhì)和蛋白質(zhì)的相互作用),rna-seq(把細(xì)胞里的所有rna分子作為一個(gè)整體測序),dnase-seq(把染色質(zhì)上對dna酶敏感的區(qū)域,也就是結(jié)構(gòu)較疏松較暴露的區(qū)域給測序),等等等等。

    可惜當(dāng)時(shí)還沒有crispr,否則檢測基因組區(qū)域的功能(不管編碼非編碼)是非常地合適(canveretal.,2017)。
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